Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM15Q9C019 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms