Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIOK2Q9BVS4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms