Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3R4Q99570 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3R4Q99570 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms