Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDC1Q96MU7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms