Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRC1Q96M27 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRC1Q96M27 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms