Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GCN1Q92616 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms