Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms