Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRFBP1Q8NEF9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRFBP1Q8NEF9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRFBP1Q8NEF9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRFBP1Q8NEF9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRFBP1Q8NEF9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms