Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms