Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms