Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms