Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK5Q16478 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK5Q16478 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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