Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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