Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAMK2BQ13554 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAMK2BQ13554 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms