Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ITGB3BPQ13352 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGB3BPQ13352 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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