Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GRIK3Q13003 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK3Q13003 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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