Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms