Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC173Q0VFZ6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms