Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACVR1Q04771 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms