Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXC5Q00444 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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