Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNNI2P48788 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNNI2P48788 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms