Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCLMP48507 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCLMP48507 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms