Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GDF5P43026 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GDF5P43026 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GDF5P43026 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms