Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTR1BP42025 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms