Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJC1P36383 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJC1P36383 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJC1P36383 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms