Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTX3P26022 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTX3P26022 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms