Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA3P25788 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms