Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms