Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRHP20396 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRHP20396 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRHP20396 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRHP20396 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRHP20396 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRHP20396 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms