Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms