Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA4P06727 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA4P06727 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms