Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOBPA7XYQ1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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