Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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KCNIP3Q9Y2W7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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