Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM2AQ9Y2K7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms