Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCHIP1Q9P0W5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms