Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP4F12Q9HCS2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP4F12Q9HCS2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms