Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms