Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms