Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPRY1Q96DX4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms