Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms