Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL24A1Q17RW2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms