Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRF1Q16656 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms