Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITSN1Q15811 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITSN1Q15811 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms