Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNHIT3Q15649 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms