Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms