Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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