Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCARF1Q14162 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms