Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL1Q13616 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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