Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms