Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF5Q13243 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms